Problema de altura en el eje Z

Hola a todos. Tengo una CNC3040 con motores nema 23 con electrónica mesa 7I96 y husillos de bolas recirculantes.
    la utilizo para la fabricación de prototipos de placas de circuito impreso o PCB, pues antes de empezar ha hacer el trabajo tengo que subir y bajar muchas veces el eje Z para que corte a la medida exacta... Por ejemplo. 
Mando el comando para que los ejes se posicionen en el origen de la pieza y le cargo el archivo gcode y le doy a empezar. Pues observo que no está cortando a la altura correcta, vuelvo a mandar los ejes al origen máquina y vuelvo a darle a comenzar el trabajo y vuelve a cortar a la altura incorrecta y vuelvo a repetir el ciclo hasta que en una de esas ya corta a la altura correcta y ya no vuelve a perder la altura y termina el trabajo perfectamente, en los ejes X e Y no le pasa eso ¿Alguien sabe que le pasa al eje Z y como podría corregir el problema?.
Saludos

Possibly  like an issue with:

1. Z home switch

2. home switch debouncing

3. home latch velocity too high

Hola, buenos días, no creo que ese sea el problema, ya que el interruptor de inicio home solo se utiliza una sola vez cuando enciendo la máquina luego ya no lo utilizo para nada más.
la velocidad de home es muy baja, la máxima velocidad a la que la máquina puede funcionar es de 1700 y la velocidad del primer contacto con el interruptor de home lo tengo a 100 y el segundo contacto que es para el ajuste fino la tengo configurada a 3.

Digo que no creo que sea ese el problema por que para empezar a fresar la PCB tengo que subir y bajar el eje Z muchas veces antes de empezar, ya sea haciendo home de pieza (que no es el home de la máquina) o subiendo y bajando el eje manualmente y una vez empieza a cortar a la medida correcta y ya no se desvía en todo el trabajo que puede tardar una hora, y en el transcurso del trabajo el eje Z sube y baja muchas veces por que tienen que moverse de zona y para eso sube se desplaza y vuelve a bajar para seguir cortando y lo hace perfecto, el problema es al empezar que no sé por qué le pasa eso

In any case, it seems like the Z axis homing is unreliable

If the latch velocity is low than this seem more like a switch/mechanical  or debounce issue